Trung tâm có chức năng phục vụ quản lý nhà nước về lĩnh vực nông nghiệp và cung cấp các dịch vụ công liên quan đến:
Kiểm chứng kỹ thuật: Xác định chất lượng, hàm lượng dinh dưỡng và tính an toàn của sản phẩm.
Giám định chuyên môn: Đưa ra các kết luận khoa học phục vụ công tác thanh tra, kiểm tra.
Hỗ trợ doanh nghiệp: Giúp các đơn vị sản xuất hoàn thiện hồ sơ chất lượng để đưa hàng hóa ra thị trường hoặc xuất khẩu.